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盘点2020 | 百趣协助客户发表文章TOP6

分类:公司动态   发布时间 2021-01-13   阅读: 212

2021年到了,回顾充满变数的2020年,即使它再跌宕起伏也没能阻止我们科研的步伐。在无数热爱科研的小伙伴的努力奋斗下,过去一年里依然涌现了不少优质文章。今天小编就给大家盘点一下,2020年百趣生物协助客户发表文章TOP6,快来看看有没有和你研究方向相关的吧。

1.三阴性乳腺癌“复旦分型”再开新路,治疗需要“各行其道”

代谢组学

文章标题:Metabolic-Pathway-Based Subtyping of TripleNegative Breast Cancer Reveals PotentialTherapeutic Targets
发表期刊:Cell Metabolism
影响因子:21.567
发表时间:2020年11月12日
合作客户:复旦大学附属肿瘤医院
百趣生物提供服务:LC-MS非靶标代谢组学及经典脂质组学检测分析

三阴性乳腺癌(TNBC)是一种异质性的疾病,也是目前乳腺癌治疗中最棘手的一种,TNBC占所有乳腺癌病例的12%-17%,但由于早期复发率高和治疗选择有限,其预后非常糟糕。在过去的十年里,人们一直致力于将TNBC分为几个分子亚型,这些分子亚型具有不同的突变特征、基因组改变和生物学过程,以此可以指导治疗策略。然而,由于样本量小和缺乏多组学数据,很少有研究从代谢失调和异质性的角度对TNBC进行基因组分析。其他先前的研究主要集中在基于基因组扰动的泛癌症代谢失调分析上,这可能导致对TNBC代谢异质性的理解不足。

对此复旦大学邵志敏团队全面评估了哪些代谢途径改变了TNBC的整体代谢转录谱,并成功地在86种不同代谢途径的基础上确定了三种TNBC代谢亚型。这三种基于代谢途径的亚型(MPSs)具有不同的代谢基因表达、代谢产物丰度、基因组驱动因子以及对各种代谢抑制剂的存活率和敏感性。邵志敏团队分析证明了TNBC的代谢异质性,并使独特肿瘤代谢谱的个性化治疗得以发展。

2.Gut:高胆固醇饮食与脂肪肝相关肝癌的关系,终于有研究证据了!

代谢组学


文章标题:Dietary cholesterol drives fatty liver-associated liver cancer by modulating gut microbiota and metabolites

发表期刊:Gut
影响因子:19.819
发表时间:2020年7月
合作客户:香港中文大学
百趣生物提供服务:LC-MS非靶标代谢组学

非酒精性脂肪性肝病(Non-alcoholic fatty liver disease , NAFLD)是全世界日趋普遍的慢性肝病。随着肥胖和代谢综合征在全球的流行,近20年亚洲国家NAFLD增长迅速,在上海、北京、广州和香港等地区成人NAFLD患病率约在30%左右。NAFLD可进展为非酒精性脂肪性肝炎(Non-alcoholic steatohepatitis, NASH), 进而发展为肝硬化甚至肝癌(Hepatocellular carcinoma, HCC)。NAFLD相关肝癌的发病率在过去10年增加了4倍,相应的医疗保健费用也在逐步增加。

2020年7月份香港中文大学于君老师的研究团队在《Gut》发表了一篇研究高胆固醇饮食对于调节肠道菌群及其代谢产物在驱动NAFLD-HCC中作用的文章,发现了胆固醇抑制疗法和改变肠道菌群对于该疾病的作用,为以后预防NAFLD-HCC提供了有效策略。

这项研究首次发现了长期的高胆固醇饮食,会通过调节肠道菌群来诱导小鼠NAFLD-HCC形成和发展:胆固醇通过肠道菌群的变化使TCA升高、IPA降低,促进脂质积累和肝细胞增殖,从而导致NAFLD-HCC的发展。而通过降胆固醇治疗,可以阻止高胆固醇饮食诱导的NAFLD-HCC。这意味着,调控胆固醇和肠道菌群及其相关代谢产物可能为以后预防NAFLD-HCC提供有效策略。

3.Gut(IF=19.819):时间序列分析研究人在长期密闭环境下的微生态和代谢物变化
代谢组学

文章标题:Time series analysis of microbiome and metabolome at multiple body sites in steady long-term isolation confinement
发表期刊:GUT
影响因子:19.819
发表时间:2020年9月10日
合作客户:深圳市绿航星际太空科技研究院
百趣生物提供服务:代谢组+16s检测分析

本研究共募集了4位模拟航天员进行180天的受控生态生命保障系统集成试验(CELSS),一共获取了18个时间的样本,主要包括进舱前(Before)、在舱中(M1+M2+M3)和出舱后(After),其中获取的唾液和粪便样本进行微生物检测,血浆、尿液和粪便样本进行代谢组学检测,通过将人的多个部位样本的代谢组学和宏基因组学结果进行联合分析,用于评估人体微生态系统和代谢稳态与密闭环境间的相互作用。

本研究发现人在CELSS居住180天,人体多部位的微生态和代谢出现了一定的动态变化。部分变化与疾病的潜在发生具有密切关系,且在整个过程中两个不同部位菌群的变化具有一定的稳定性,这与Turroni等的发现具有一定的一致性。该研究加强了我们对人在长时间密闭环境下菌群和代谢稳态变化的了解,为未来实现更长时间的CELSS试验或太空飞行提供一定的支持和帮助。

4.Gut重磅突破:小小肠道菌群决定肾的“生死”

代谢组学

文章标题:Aberrant gut microbiota alters host metabolome and impacts renal failure in humans and rodents
发表期刊:Gut
影响因子:17.943
发表时间:2020年4月2日
合作客户:中国农业大学
百趣生物提供服务:VOCs非靶标代谢组学检测分析以及靶标代谢组学检测分析服务

终末期肾病(ESRD)是慢性肾脏病(CKD)的一种晚期并发症,是全世界引起高死率亡的主要原因之一。目前,治疗ESRD的费用惊人,仅在美国每年大约需要花费340亿美元。

2020年4月2日,阿趣生物协助客户中国农业大学任发政院士和于政权教授与团队在国际权威期刊《Gut》(IF:17.943)上发表了关于ESRD的最新研究成果,整合肠道菌群、血清和粪便代谢组多组学数据,建立223名血液透析患者和69名健康对照者的大规模队列,以及24名个体的独立验证队列,表明产毒的肠道菌群通过产生有害代谢物加重ESRD临床预后,揭示在未来的临床对照实验(CCT)中可通过调节肠道菌群的方法降低患者的尿毒症毒性,提高生存质量或减少对透析治疗和肾移植资源的需求。

5.阿趣生物助力预测肝癌治疗关键靶点,或成治疗新策略

代谢组学

文章标题:PGC1α suppresses metastasis of HCC by inhibiting Warburg effect via PPARγ-dependent WNT/β-catenin/PDK1 axis
发表期刊:Hepatology
影响因子:14.97
发表时间:2020年4月
合作客户:上海市肿瘤研究所
百趣生物提供服务:LC-MS非靶标代谢组学检测分析服务

肝癌是全球第六大肿瘤,排在因癌症疾病死亡的第四位。2015年,全世界肝癌发病85.4万例,死亡81万人,半数病例和死亡发生在中国。肝细胞癌占原发性肝癌的75%-85%。虽然肝癌的诊断和治疗已经取得进展,但治疗后5年生存率仍为25%-39%,晚期肝癌患者的复发率约为80%。因此,迫切需要了解肝癌进展和转移的机制,这将有助于制定治疗方案,同时延长肝癌患者的生存期。 

发表在Hepatology杂志,IF=14.97,标题为PGC1α suppresses metastasis of HCC by inhibiting Warburg effect via PPARγ-dependent WNT/β-catenin/PDK1 axis的文章。研究并探讨了PGC1α对肝癌预后的影响,并发现PGC1α可能是肝癌患者的候选治疗靶点,有望为肝癌治疗提供新思路。

文章首先研究了PGC1α在肝癌转移和代谢中的作用和机制。PGC1α通过抑制WNT/β-catenin途径下游靶点PDK1的有氧糖酵解抑制肝癌细胞的体内外转移。PGC1α对WNT/β-catenin通路的抑制作用依赖于PPARγ。本文阐明了PGC1α作用的新见解,并提示PGC1α可能是肝癌新治疗策略的一个有希望的靶点。

6.低氧诱导的GBE1表达通过肺腺癌的代谢重编程促进肿瘤进展


代谢组学


文章标题:Hypoxia-induced GBE1 expression promotes tumor progression through metabolic reprogramming in lung adenocarcinoma
发表期刊:Signal Transduction and Targeted Therapy
影响因子:13.493
发表时间:2020年5月
合作客户:郑州大学第一附属医院
百趣生物提供服务:代谢组(GCMS和LCMS)

肿瘤缺氧已被鉴定为患者预后差的预后因素。缺氧很可能诱导癌基因和其他肿瘤发展动因赋予侵袭性表型。低氧诱导了从氧化磷酸化到糖酵解和糖原合成增加的代谢转换;这种代谢重编程有利于肿瘤生长。尽管已经阐明了在低氧下糖酵解调节的机制,但仍需要解决低氧对糖原代谢命运的影响。作者团队前期研究结果表明GBE1可能是实现肺腺癌(LUAD)肿瘤消退的潜在靶标。但是,GBE1在癌症生物学和临床肿瘤学中的重要性和调控尚不清楚。这篇文章进一步深入研究作用机制并提供了新颖的见解,表明缺氧诱导的HIF1α介导GBE1上调,从而通过LUAD肿瘤微环境中的NF-κB信号通过启动子甲基化抑制FBP1表达。FBP1的下调导致HIF1α增强,转换为厌氧糖酵解,并增加LUAD细胞的葡萄糖摄取。因此,针对HIF1α/ GBE1 /NF-κB/ FBP1轴的治疗策略可能代表LUAD的有效治疗方法。

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代谢组学