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样本收集手册 | 粪便/肠道内容物的收集方法及注意事项

分类:公司动态   发布时间 2021-03-19   阅读: 1236

各位老师、同学好。本周小编继续为热爱科研的您们提供干货,愿大家的科研之路一往无前。承接上期《样本收集手册 | 血清、血浆、尿液的收集方法及注意事项》,这周为大家带来“粪便/肠道内容物”的收集protocol。

粪便Feces (方法也适用肠道内容物样本)

样品量要求: 
200mg/sample。
注意:一定避免反复冻融。

样本收集步骤: 
取新鲜粪便或肠道内容物样本,置于冻存管中收集好后,每管取200mg,然后立即用液氮速冻处理30s以上,保存至-80℃冰箱,足量干冰低温运送。

注意事项: 
1)由于粪便/肠道内容物中有非常多的微生物,且微生物代谢速度非常快,故避免反复冻融。

2)建议分装多备份,盛放粪便容器尽可能使用冻存管,若使用其余容器请务必保证容器质量,避免盖子在干冰寄送过程中脱落和容器在干冰寄送过程中损坏等情况的发生。

3)动物(如家禽类,鱼类)肠道内容物,务必在取样前将肠道组织和内容物分离开,单独寄送肠道内容物,切勿不分离直接干冰寄送。

4)注意粪便样本含水率问题,如取样环节发现含水率异常,则可以考虑更换,尤其人粪便样本(实验设计专门研究含水率相关课题除外)。 

收集方法参考文献: 
[1]Cameron S J S , Alexanders J , Bolt F , et al. Evaluation of Direct from Sample Metabolomics of Human Faeces using Rapid Evaporative Ionisation Mass Spectrometry (REIMS)[J]. Analytical Chemistry, 2019. 

[2]Hans-Frieder, Schoett, Sabrina, et al. A validated, fast method for quantification of sterols and gut microbiome derived 5α/β-stanols in human faeces by isotope dilution LC-high resolution MS.[J]. Analytical Chemistry, 2018.

[3]J Gratton,J Phetcharaburanin,B Mullish,et al. An optimized sample handling strategy for metabolic profiling of human feces.[J]. Analytical Chemistry, 2016.

最后附上我司协助客户发表的文献(参考我司粪便取样的protocol),以便各位老师、同学在设计课题、文章撰写等环节可参阅和引用。

1. 中国农业大学:Xifan Wang, Songtao Yang, Shenghui Li, Liang Zhao, et al. Aberrant gut microbiota alters host metabolome and impacts renal failure in humans and rodents. Gut. 2020. IF=17.943

2. 深圳市绿航星际太空科技研究院:Feng Q, Lan X, Ji X, et al. Time series analysis of microbiome and metabolome at multiple body sites in steady long-term isolation confinement. Gut 2020 September 10. IF=19.819

3. 中国科学院亚热带农业生态研究所: Ren W, Wang P, Yan J, et al. Melatonin alleviates weanling stress in mice: Involvement of intestinal microbiota. J Pineal Res 2017; 64(2). IF=10.391

4. 重庆医科大学附属第一医院: Xinyue Huang,Zi Ye, Qingfeng Cao,et al.Gut Microbiota Composition and Fecal Metabolic Phenotype in Patients With Acute Anterior Uveitis. Investigative Ophthalmology & Visual Science 2018;59:1523-1531. IF=3.388


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