功能代谢组学是在传统的以发现差异代谢物为主要目的的非靶标、靶标代谢组学基础上，综合结合分子细胞生物学实验、同位素标记、宏基因组、转录组和蛋白组等多种技术手段，探究差异代谢物的生物功能以及相关生理病理意义的一种新方法，是传统代谢组学概念的深化和延伸。