技术介绍 | 发现代谢组学Classic-亲水版
发布时间 2022-11-11
通过液质联用(LC-MS)方法检测生物体受外界刺激前后体内大多数小分子代谢物的动态变化,重点寻找在实验组和对照组中有显著变化的代谢物,进而研究这些代谢物与生理病理变化的相关关系,其研究对象大都是分子量1500Da以内的小分子物质。

应用方向

▶ 表型和生理功能研究

▶ 疾病病理研究

 临床诊断及治疗

 中医理论研究

 食品科学与营养学研究

 药物研究


技术优势

▶ 双核定性匹配算法

▶ 较高的灵敏度、分辨率

 较宽的动态范围

 适合于生物样本中复杂代谢产物的检测和潜在标志物的鉴定

 适合对标本中未知代谢物的探索研究

 定性准:6D质控体系


技术流程

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技术参数

▶ 样本要求

血清、血浆:200μL/sample

尿液:1mL/sample

组织:200mg/sample

粪便、肠道内容物:200mg/sample

细胞、微生物:1×107cells/sample

培养液:200μL/sample

▶ 生物学重复

样本数量:植物和微生物n≥6,动物样本n≥10,临床样本n≥30,所有重复样本独立分析其他种类的样品在收集之前请联系公司销售工程师

▶ 检测平台

Q Exactive HFX, Thermo


案例分析

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文章标题:IgG4相关性硬化性胆管炎和原发性硬化性胆管炎中粪便微生物组和代谢组的改变

研究对象:硬化性胆管炎
期刊:Gut
影响因子:31.793
时间:2021年


研究背景


IgG4相关硬化性胆管炎(IgG4-SC)与原发性硬化性胆管炎(PSC)有多种临床相似之处,但皮质类固醇治疗对大多数IgG4-SC患者有效,而对PSC患者存在无效性,且两种疾病的预后也不同,PSC发生肝硬化、胆管癌和结直肠癌的风险高于IgG4-SC。这两种硬化性胆管炎的发病机制目前尚不清楚。虽然在PSC中肠道菌群失调已被广泛研究,但肠道菌群在IgG4-SC中的作用机制仍不清楚。



研究结果


IgG4-SC和PSC具有不同的宿主—微生物相互作用,可能参与疾病的发病机制。研究数据强调了IgG4-SC的独特性。在IgG4-SC患者中,差异菌群和代谢物与转氨酶显著相关。Blautia菌的显著降低和琥珀酸的显著升高可能是IgG4-SC中肝脏炎症的基础。相比之下,在PSC中,菌群和代谢特征的改变与胆汁淤积表型相关,尤其是Eubacterium和菌群代谢物(包括次级胆汁酸)在PSC中均显著降低。而且,基于代谢物的预测模型在区分疾病状态方面比基于菌群的预测模型更有效。



研究路线


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结果展示


在IgG4-SC中唯一改变的27种代谢物中,大多数(n=23,85%)在疾病组增加。这些包括几种潜在的促炎症介质、二十二碳五烯酸、8,11,14-二十碳三烯酸、花生四烯酸、羟基异丙酸等。在PSC中鉴定出67种代谢物发生了变化。与IgG4-SC相比,大多数代谢物(n=49,73%)在疾病组表现出较低的水平。由肠道细菌代谢的次级胆汁酸,包括脱氧胆酸(DCA)、石胆酸(LCA)和甘氨酸结合石胆酸(GLCA),在PSC中显著减少。

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PSC和IgG4-SC组与HC的粪便代谢组差异


有兴趣采用发现代谢组学Classic-亲水版进行样本检测分析的老师,欢迎垂询服务热线:400-664-9912,也可在本文或微信公众号后台给我们留言。


参考文献:

Qiaoyan Liu, Bo Li, et al. Altered faecal microbiome and metabolome in IgG4- related sclerosing cholangitis and primary sclerosing cholangitis[J]. Gut, 2021.


文献下载链接:

https://pan.baidu.com/s/1J0m5R5SxKMU7GH-2fov0Uw

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