2022年靶向代谢组学合作文章集锦,经典案例助力科研不费力!
发布时间 2022-05-17

2022年百趣生物的靶向代谢客户文章平均影响因子高达12分,本期百趣小趣就带大家看看我们百趣合作客户近期发表的高分文章:



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微生物代谢产物TMAO促进三阴性乳腺癌的抗肿瘤免疫

IF:27.287

作者单位:复旦大学肿瘤医院

期刊:Cell Metabolism

百趣提供服务:氧化三甲胺代谢物检测

文献解读链接可查看:合作文章(IF 27.287)| 复旦团队为三阴性乳腺癌治疗策略再添新翼



研究背景

三阴性乳腺癌(TNBC) 是一种侵袭性疾病,预后差,免疫治疗在患者中取得的成功有限。三阴性乳腺癌(TNBC)的四种亚型中,IM亚型的特点是在微环境中富集免疫激活细胞和免疫刺激因子,提示TNBC的IM亚型患者可能对免疫治疗有更好的反应。因此,迫切需要找到调节TNBC微环境、促进抗肿瘤免疫的因子。


研究方法

对FUSCCTNBC队列(n=360)的转录组、代谢组和微生物组数据进行了全面分析。


研究结果

发现梭菌属和相关代谢物三甲胺N-氧化物(TMAO)在具有激活免疫微环境的肿瘤中更为丰富,血浆中TMAO较高的患者对免疫治疗的反应更好。从机制上讲,TMAO通过诱导肿瘤细胞焦亡,从而增强TNBC体内CD8+T细胞介导的抗肿瘤免疫,提高免疫治疗疗效。


研究结论

该研究为微生物群-代谢-免疫相互作用提供了新的见解,并表明微生物代谢物,如TMAO或其前体胆碱,可能代表了一种新的治疗策略,以促进免疫治疗对TNBC的疗效。



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抽烟会通过调节肠道微生物群和相关代谢物促进结直肠癌

IF:23.059

作者单位:香港中文大学

发表期刊:Gut

百趣提供服务:胆汁酸代谢物,非靶标代谢组学检测

文献全文解读链接更新中... ...


研究背景

吸烟是结直肠癌(CRC)的主要危险因素。本文旨在调查香烟烟雾是否会通过改变肠道微生物群和相关代谢物来促进结直肠癌。


研究方法

使用偶氮甲烷处理C57BL/6小鼠,然后每天暴露于香烟烟雾或清洁空气中2小时,持续28周。收集小鼠粪便上进行宏基因组测序和代谢组学分析,并且将烟雾暴露组和无烟对照小鼠的粪便移植给无菌小鼠。


研究结果

与无烟对照小鼠相比,香烟烟雾暴露的小鼠肿瘤发病率和细胞增殖显著增加。在烟雾暴露的小鼠中观察到肠道微生物菌群失调,细菌种类的丰度存在显著差异,包括Eggerthella lenta的富集,Parabacteroides distasonis和Lactobacillus spp的消耗。代谢组学分析显示,烟雾暴露小鼠的结肠中胆汁酸增加,尤其是牛磺脱氧胆酸(TDCA)。作者发现E.lenta与烟雾暴露的小鼠中的TDCA呈正相关。此外,烟雾暴露小鼠发现了增强的致癌MAPK/ERK信号(TDCA的下游靶标)和肠道屏障功能受损。在移植了烟雾暴露组小鼠粪便的无菌小鼠中,发现其结肠细胞增殖增加,肠道大肠杆菌和TDCA的丰度增加,MAPK/ERK通路被激活并且结肠上皮的肠道屏障受损。


研究结论

香烟烟雾引起的肠道菌群失调在结直肠癌中具有促肿瘤作用。烟雾引起的肠道菌群失调会改变肠道代谢物并损害肠道屏障功能,这可能会激活结肠上皮中的致癌 MAPK/ERK 信号传导。


通过SOCE-Calcineurin-NFAT和糖酵解途径抑制钙信号传导可防止CAR-T细胞衰竭并增强抗白血病功.png

通过SOCE-Calcineurin-NFAT和糖酵解途径抑制钙信号传导可防止CAR-T细胞衰竭并增强抗白血病功效

IF:16.8

作者单位:浙江大学附属第一医院

发表期刊:Advanced Science

百趣提供服务:中心碳代谢物检测

文献全文解读链接更新中... ...


研究背景

嵌合抗原受体(CAR)T细胞是识别和消除肿瘤的有效药物,在治疗难治性白血病和淋巴瘤患者方面取得了显著成功。然而,T细胞自身的功能障碍如衰竭,是阻碍维持疗效的关键,也是亟待解决的国际性难题。作者旨在通过体外和体内的CAR强直信号或肿瘤抗原暴露来评估钙介导的CAR-T细胞衰竭和终末分化的机制。


研究方法

使用来自不同健康供体的T细胞进行体外转录、代谢、分子实验。在接种T细胞之前,将小鼠随机分配到对照组和治疗组。


研究结果

作者首先发现钙信号通过CAR-T细胞中持续的强直信号被过度激活。接下来发现钙池操纵钙离子内流(SOCE)抑制剂 BTP-2可以显著减少CAR-T细胞衰竭和CAR-T细胞在自发信号传导和肿瘤抗原暴露模型中的终末分化。此外,BTP-2预处理的CAR-T细胞显示出抗肿瘤效力提高和体内存活率延长。从机制上讲,转录组和代谢物分析表明,用BTP-2治疗可显著下调SOCE-钙调神经磷酸酶-活化T细胞核因子(NFAT)和糖酵解途径。


研究结论

调节CAR-T细胞中的SOCE-钙调神经磷酸酶-NFAT通路和糖酵解途径使它们能够抵抗衰竭,从而产生具有增强抗肿瘤效力的CAR产品。


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