代谢物-蛋白质相互作用控制着多种细胞过程，从而在维持细胞稳态中发挥重要作用。MetPro技术是一种化学蛋白质组学方法，将蛋白质水解(LiP)和质谱(MS)结合起来。用于进行代谢物-蛋白质相互作用的研究，筛选与代谢物具有相互作用的蛋白质。
▶ 发现药物的作用靶点；
▶ 研究小分子代谢物的作用机制；
▶ 小分子代谢物作用机制研究：研究小分子代谢物对生化过程、信号通路等的影响；
▶ 网络图构建：与其他功能组学数据结合如PPI网络、PTM蛋白质翻译后修饰或代谢流，为不同细胞调控层之间的交互影响(crosstalk)带来新方向。
MetPro技术流程
▶ 样本要求
动物及临床组织标本：100mg/sample
血清、血浆：200uL/sample
细胞：1×108cells/sample
微生物：1×109cells/sample
液氮或-80℃保存
足量干冰运输，避免反复冻融
▶ 代谢物要求
标准品溶液参考 代谢物浓度：>=33mM；体积>=50ul
标准品粉末需根据小分子量换算，换算公式为：m=n*M
例：标准品分子量为700，所需量为m=700*0.05ml*33mM=1.155mg（不足1mg需提供1mg）
▶ 产品类型
MetPro-II
▶ 仪器平台
Orbitrap系列(Q Exactive HFX,Thermo/Orbitrap Exploris 240,Thermo等)
▶ 搜库软件
Proteome Discoverer/MaxQuant
▶ 简单高效的发现小分子代谢物与蛋白相互作用，灵敏度高；
▶ 不需要对配体进行任何化学修饰，也不偏向具有特定性质的化合物；
▶ 直接在复杂的生物样品中展开研究，而不需要进行蛋白质纯化或浓缩。
代谢物与蛋白质的相互作用控制着多种细胞过程，因此在维持细胞内稳态方面起着重要作用。代谢物在细胞中分子占最大部分，但目前对代谢物-蛋白质相互作用组的了解落后于对蛋白质-蛋白质或蛋白质-DNA相互作用的理解。在这里，作者提出了一种化学蛋白质组学方法流程，用于直接在天然环境中系统地鉴定代谢物-蛋白质相互作用。该方法在大肠杆菌中发现了一个已知的和新的相互作用和结合位点的网络，证明了一些新发现的相互作用的功能相关性。这些数据能够识别新的酶-底物关系和代谢物诱导的蛋白质复合物重塑案例。研究发现代谢物-蛋白质相互作用组由1,678个相互作用和7,345个假定的结合位点组成。该数据揭示了化学通讯的功能和结构原理，阐明了酶混杂的流行和机制，使在蛋白质组范围内提取代谢物结合的定量参数成为可能。
研究流程图
有兴趣采用MetPro-Ⅱ代谢物与蛋白相互作用进行样本检测分析的老师，欢迎垂询服务热线：400-664-9912，也可在本文或微信公众号后台给我们留言。
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