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空间蛋白质组学

近几年,空间蛋白质组学技术的热度与日俱增,在2022年&2023年均被Nature杂志列为值得关注的七大榜单技术之一。空间蛋白质组学的应用非常广泛,包括但不限于组织器官空间图谱构建、肿瘤异质性研究、微环境与疾病发展研究、药物靶点与机制研究等。例如,它可以用于揭示肿瘤组织内部的异质性,帮助更准确地判断肿瘤类型、分级和预后,并为患者制定更合适的治疗方案;还可以用于疾病关键靶点与生物标志物的发现,为未来的疾病治疗提供新的思路和方法。随着技术的不断进步,在空间蛋白分布研究的基础上,对于空间分辨率的要求已经提升至“单细胞级别”,空间蛋白质组学将在未来发挥更大的潜力,为人类健康事业做出更多贡献。


技术流程

空间蛋白质组学(图1)


送样建议

1.组织块:FFPE组织块、OCT包埋冰冻组织块

2.切片:FFPE切片、OCT切片(冰冻切片)

FFPE类样本冰袋运输、OCT类样本干冰运输


项目案例


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应用文献

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COVID-19(由SARS-CoV-2引起)对公共卫生构成严重的威胁,尽管已经有疫苗和靶向药物的开发,但对重症病例的治疗方案仍然不足。本研究旨在深入探究新冠肺炎导致肺部损伤的蛋白质基础,并通过高分辨率的空间蛋白组学方法揭示其分子机制。研究人员结合激光显微切割成像技术和超高灵敏度蛋白质组学技术,对COVID-19患者的肺部组织中的三个基本结构(即肺泡上皮(AE)、支气管上皮(BE)和血管(VE))以及四个病理改变区域(支气管粘液栓(BMP)、肺部纤维化(PF)、肺泡内炎性细胞浸润(ASI)和增生性ll型肺泡细胞(HAT2))进行了分析,并鉴定出超过10,000种蛋白质,同时与非COVID-19对照组进行比较分析,揭示了COVID-19患者肺部组织中存在的多种蛋白质表达水平变化和功能异常,为COVID-19的治疗提供了重要的参考依据。


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图1 本研究机制图解

参考文献:

1.Yiheng Mao,et al.2024.Deep spatial proteomics reveals region-specific features of severe COVID-19-related pulmonary injury. Cell Reports.


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