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Metpro -Ⅱ Protein-Metabolite Interactions
蛋白质与小分子代谢物之间的分子识别在调节蛋白质功能和控制各种细胞过程中起着至关重要的作用。代谢酶、转录因子、转运蛋白和膜受体的活性都可以由蛋白质-代谢物相互作用(PMIs: protein-metabolite interactions)介导,从而将细胞代谢与遗传/表观遗传调控、环境感知和信号转导联系起来。除了直接与天然同源蛋白的活性或正构位点结合外,已知代谢物还能与不同的变构位点相互作用,从而可以对蛋白质和大分子蛋白组装结构和功能进行额外的特殊调节。MetPro代谢蛋白互作研究(PMIs)是一种评估蛋白质组与相关代谢物结合的方法,可揭示新的变构和酶功能,可为研究药物在原生细胞环境中的靶点提供一个很好的研究工具。
技术优势
简单高效的发现小分子代谢物与蛋白相互作用,灵敏度高
不需要对配体进行任何化学修饰,也不偏向具有特定性质的化合物
直接在复杂的生物样品中展开研究,而不需要进行蛋白质纯化或浓缩
应用方向
小分子代谢物互作蛋白的研究
药物靶点预测
小分子代谢物作用机制研究:研究小分子代谢物对生化过程、信号通路等的影响
PMI网络图构建:与其他功能组学数据结合如PPI网络、PTM蛋白质翻译后修饰或代谢流,为不同细胞调控层之间的交互影响(crosstalk)带来新方向